All'inizio arrivò solamente un'astronave, un popolo alieno, chiamato reptilyans, che vagava attraverso l'universo in cerca di un nuovo pianeta su cui vivere, dopo che un cataclisma cosmico aveva distrutto il proprio pianeta. Si mostrarono all'umanità dicendo che venivano in pace, almeno all'inizio fu così. I fratelli dello spazio, come vennero identificati gli alieni, si integrarono all'uomo e iniziarono una nuova vita insieme, fino a quando, alcuni anni dopo l'arrivo di quell'astronave, i cieli del pianeta si riempirono di altre astronavi, simili alla prima. Ci fu una tremenda guerra e l'umanità ne uscì tremendamente sconfitta. Nel frattempo alcuni ribelli reptilyans, appartenenti ad un gruppo chiamato La Nuova Via, cerca alleati tra i terrestri per formare l'esercito della resistenza sulla Terra, costruendo basi sotterranee ovunque. Joe, il protagonista, è cresciuto in una di quelle basi della resistenza, da dove è fuggito quando i reptilyans la attaccarono e la distrussero. Rimasto solo, Joe inizia il suo viaggio attraverso quei territori selvaggi e invasi dagli alieni, in cerca di altre basi della resistenza, per unirsi a loro e combattere i reptilyans. Durante il viaggio incontra due membri della resistenza, con i quali attaccano un avamposto alieno nel tentativo di liberare alcuni prigionieri umani. Si mettono in viaggio per tornare alla base dei due, insieme ad un terzo uomo trovato in quell'avamposto, un prigioniero di guerra catturato dai reptilyans e appartenente all'esercito degli Stati Uniti d'America. Durante il viaggio verso la base della resistenza, incontrano un maestro reptilyans. Il quale stava cercando Joe da anni, dicendo che il ragazzo fosse il figlio di un cavaliere reptilyans, destinato a combattere l'imperatore alieno e distruggerlo. Tramite il maestro, Joe e i suoi amici vengono informati sulla reale situazione della guerra. L'impero reptilyans ha conquistato gran parte della galassia e la guerra non è limitata solo al pianeta Terra, ma sta impegnando tutta la galassia.