Dio Brando è vivo. Prima dell'esplosione del vascello su cui si era consumata l'ultima battaglia con Jonathan Joestar, Dio era riuscito a impossessarsi del corpo del rivale e rifugiarsi in una bara, attendendo nelle profondità dell'oceano che arrivasse il momento di tornare alla ribalta. Quando la bara viene fortuitamente ripescata quel momento infine arriva, e nei discendenti del sangue dei Joestar si risveglia un potere sopito e terrificante: lo stand, che si manifesta come un corpo o un oggetto immateriale dalle più disparate capacità. La solare Holy, figlia di Joseph Joestar e madre del teppista giapponese Jotaro Kujo, non riesce a controllare il suo stand, e ne viene sopraffatta. Per salvarle la vita Jotaro parte col nonno e un piccolo manipolo di guerrieri stand alla volta dell'Egitto, dove li attende la resa dei conti finale fra i Joestar e il sempre più potente Dio Brando. Sconfitto il portatore dello Stand Wheel of Fortune, che cercava di fermare il loro viaggio nel tragitto dall'India al Pakistan, Jotaro e compagni giungono in un misterioso villaggio avvolto da una strana nebbia, dove li aspetta nientemeno che la vecchia Enya, importante alleata di Dio dotata di un tremendo quanto imprevedibile potere.