Più che parlare di livelli di minore complessità si può parlare di livelli bivariati (sistemi a due livelli) e livelli notevoli ."La finalità fu eliminata senza troppe difficoltà dalla fisica, Ma è stato sempre più difficile eliminarla dalla biologia". Basti pensare alle funzioni teleonomiche nella biologia molecolare. Ciò non esclude l'interazione con altri pezzi della realtà, ma neanche le relazioni simili. La profonda connessione della finalità con la teoria dei sistemi complessi ha portato a una rivalutazione del finalismo. La teoria della complessità non è solo rilevante a livello metodologico, ma costituisce una "nuova scienza" che riguarda tutti i campi della scienza e sintetizza la struttura della scienza stessa, dalla chimica alla fisica, dalla cibernetica alla psicologia. La filosofia meccanicistica è interna alla filosofia dei sistemi con l intento di ripensare l universo come processo di stati complessi (non entità, il che sembra riduzionistico)ma perché il sistema di materia non è stazionario, ma in movimento (entità complessa significa che l'universo è semplicemente riducibile a forme gerarchiche complesse, ma il movimento e l'esistenza di processi fa si che si creino a livelli di processo altre leggi della complessità. "Il concetto di struttura molecolare non si esaurisce nelle relazioni spaziali tra gli atomi ed è sicuramente fondamentale includervi aspetti dinamici". Il metodo scientifico quindi va da se che nel momento teorico/esplicativo, cioè la formulazione per ipotesi di una teoria o legge matematica (la legge "spiega" i dati osservati, indicando come si svolge costantemente il fenomeno studiato).consiste nella formulazione logico-matematica del fenomeno nelle sue interconnessioni sistemiche. In realtà il fenomeno non deve essere ridotto, ma deve essere individuato come un livello di complessità del sistema generale e da questo dipendono la convalida-verifica sperimentale. Quasi mai è possibile fare una verifica empirica di un sistema senza attingere dati da un sistema più generale o da un sotto-sistema. In questo senso il monismo metodologico è ammissibile se ammette questo slittamento da un sottosistema a un sistema più generale e viceversa, per il fatto che anche la semplice legge matematica dei dati è un sistema aperto, che cresce in sistemi più complessi e che decresce in sistemi meno complessi