Mentre Tristan piange la morte dell'adorata Pepa, la vita riprende lentamente il suo corso al villaggio di Puente Viejo. Emilia, che di Pepa è stata la migliore amica, è ora molto occupata a mandare avanti la locanda e finisce per trascurare la figlia Maria, che trascorre così la maggior parte dell'infanzia nella villa della nobile Francisca Montenegro, ben contenta - da parte sua di farsi carico dell'educazione della fanciulla. Maria cresce quindi nel lusso. Ma non è felice: un episodio oscuro ha lasciato un'ombra nella sua anima e la ragazza sente che non potrà mai amare nessuno. Fino al giorno in cui nella sua vita entra Gonzalo: un giovane diacono dal passato misterioso che, dopo travagliate vicissitudini, è tornato al paese in cerca delle proprie origini. Per i due ragazzi sarà l'incontro del destino, tale da cambiare in maniera ineluttabile il corso della loro esistenza. Sedici anni separano gli eventi narrati dalla prima stagione de "Il Segreto" da quelli che vedremo nella seconda: questo romanzo offre ai fan della serie tv la possibilità di sapere cosa accade in quell'arco di tempo...