L'illustrazione affronta preliminarmente il dibattito all'interno della Chiesa medievale (Conciliarismo e Riforma Cattolica) prima di sviluppare i temi etici e teologici proposti dalla Riforma protestante e i cambiamenti socio-politici da essa prodotti. Vengono descritti quindi i passaggi attraverso cui la Chiesa Cattolica ha definito la propria posizione attraverso le delibere del Concilio di Trento. Poiché il Concilio non riuscì a sanare le divergenze dottrinali con i Protestanti, la Congregazione della sacra romana ed universale Inquisizione si assunse il compito di recuperare l'ortodossia cattolica (Controriforma cattolica) perseguendo ogni deviazione rispetto alla dottrina. Simboli della crociata contro il dissenso furono i processi che portarono alla condanna al rogo di Giordano Bruno, alla prigionia di Tommaso Campanella e all'abiura di Galileo Galilei.