Siamo nell'anno 1001 del calendario di Aion. Tutti i Gate di Aion sono passati sotto il controllo della coalizione militare interstellare chiamata Gate Keepers di Aion. Dopo che il suo paese è stato distrutto Lysja, principe dell'alleanza di Zaysion, pur vivendo camuffato da idraulico desidera ardentemente uscire nell'universo. Etorouji Shiono ci prepara all'azione già dall'inizio di questa colossale opera spaziale ambientata in un remoto futuro dell'universo!