Edimburgo, 1868. È l'alba quando a casa Doyle viene recapitata una busta per Arthur: dentro c'è la lettera di ammissione a Baskerville Hall, una scuola segreta per ragazzi con doti eccezionali. Una volta arrivato a Baskerville Hall (a bordo di un dirigibile!), Arthur stringe subito amicizia con Irene Eagle, una ragazzina dagli occhi grandi e luminosi che sembra non conoscere la paura, e con Jimmie Moriarty, figlio di un pezzo grosso della finanza. I nuovi studenti scopriranno presto che la loro è una scuola speciale, con torri dalle scale ripidissime, piante carnivore, uccelli estinti, società segrete e lezioni tutt'altro che ordinarie. Ma Arthur, Irene e Jimmie scopriranno anche che a Baskerville Hall c'è qualcosa di non detto: le misure di sicurezza sono state rafforzate e pare che qualcuno abbia cercato di introdursi nella scuola. Ma in cerca di cosa? E perché il preside vuole tenerlo nascosto? L'inseparabile trio ha intenzione di andare a fondo del mistero, costi quel che costi.